西藏山南地區藏醫院成立于1982年，經過20多年的發展，醫院從一個單一的藏醫門診發展成為如今集藏醫醫療、預防、保健、康復、教學、科研、生產和銷售藏藥為一體的綜合性民族醫院。醫院率先在全區同行業中爭創成為了全國百家中醫示范醫院，率先在全區同行業中獲得了二級甲等藏醫院的榮譽稱號。是西藏藏醫學院教學醫院和山南地區醫保定點醫院。醫院先后被國家、自治區、地區授予全國民族團結進步模范單位、全國衛生系統先進集體、西藏自治區先進集體、省級“青年文明號”單位、山南地區民主評議行風滿意單位等各種榮譽稱號近20次。

目前全院共有132名職工，醫務人員占全院職工的85%以上，其中藏醫藥技術人員占80%。醫務人員中高級6人、中級48人；全院大專以上學歷含藏醫碩士研究生藏醫在內共79名，藏醫博士生導師2名。醫院擁有加央倫珠、格桑平措、扎西次仁等一批享譽區內外的知名藏醫藥專家和中青年技術骨干人員56名。全院占地面積28134.37平方米，總建筑面積15300平方米，醫院業務用房11610平方米，總資產達4500萬元。

醫院目前已開設有內科、外科、心腦血管、消化、骨傷、理療康復、藥浴保健、婦科、眼科、耳鼻喉科、口腔科等藏西結合臨床一、二級科室近20個。綜合住院大樓開設有藏醫全科、藏西醫結合、藥浴康復理療以及普外科現代手術治療等一體化的住院病區。綜合住院大樓現實際開放病床100張，擁有多種現代診療儀器設備。據統計，年門診常規就診人次6萬余人。

醫院依靠加央倫珠、嘎瑪群旦等老藏醫藥專家優勢，率先在全區藏醫同行中成功研制了藏藥原料配制技術中，技術含量最高，制藥難度最大，承擔風險性最高的“仁青坐臺”。“坐臺”稱為藥中之王和甘露，是配制“然那桑培”、“常覺”、“芒覺”等名貴藏藥和普通藏藥加“卡察”增效的必備原料，是藏藥原料中的極品。20多年以來，先后成功完成了四次“坐臺”的煉制，不僅填補了我地區藏醫藥歷史上無藏藥“坐臺”煉制的歷史空白，而且使我地區藏藥煉制技術走在了全區藏醫界前列。

醫院申報的傳統藏醫“藥浴”療法與“尿診”技術已被列為了第二批自治區級非物質文化遺產名錄，其中藏醫“尿診”技術于2008年下半年進一步提升列為了國家級非物質文化遺產名錄。