藏醫院診斷疾病的方法主要靠問診、望診、觸診。診斷病人患有何病叫做認病，認病主要靠征候，病和征候的關系好比火和煙的關系一樣，火是煙的基礎，煙是火的表現。所以認病必須先認識征候。不懂得這個道理的醫生，就認不清病人的征候，好象錯誤地把水蒸氣看成為煙霧,或見云就以為準要下雨一樣, 把不可靠的東西看成可靠的東西。要確診疾病，分析病的征候非常重要。
       1．問診--凡與病情有關的情況均要仔細詢問，包括起病的原因，發病的時間，癥狀，用藥物的情況，發病與季節氣候和飲食起居的關系等。特別是病因，患病的部位和癥狀，應當-一問清楚（三診中心問診為最重要）。
       2．望診--凡能用眼睛看到的都要觀察，包括病人的神色、體型、皮膚顏色、大便、小便、痰等。特別要仔細觀察舌和尿的變化，舌診主要是看舌質和舌苔。例如，龍病的病人，舌質紅，舌苔干而粗糙；赤已病的病人舌苔黃而厚；培根病的病人，舌苔白而滑等。尿診是藏醫觀察疾病極為重要的手段之一，因此，觀察十分仔細。尿診的方法是：醫生首先看尿的顏色或冒熱氣的情況（尿蒸氣的情況），嗅氣味等，然后用一根細棒攪拌尿液，看尿的泡沫（包括泡沫多少、大小、顏色、消失快慢）、沉淀物之有無及其形狀、漂浮物等的變化。例如，熱性病人的尿呈紅黃色，氣味大，有臭味，尿的熱氣維持時間久，泡沫稀少呈黃色，且消失快，沉淀物如亂云狀。又如，尿中沉淀物形狀似砂粒者為腎有病。
       3．觸診：主要是切脈。藏醫切脈的部位和方法基本上與中醫相同。亦分寸、關、尺三部，且其藏語的發音亦與漢語相近，即"寸、甘、恰"。切脈的手法分浮取、中取、沉取三種，寸、關、尺三部所代表的臟腑，男女略有區別，男子左手之寸、關、尺脈分別反映心、脾、腎（左腎）及"三姆休"；右手之寸、關、尺脈分別代表肺、肝腎（右腎）。婦女寸脈反映為臟腑，左手為肺，右手為心，其余相同。正常人一息（一呼一吸）脈跳五次，柔和有規律。而多于五次者有熱、少于五次者有寒。脈象因病而異，主要分十二種。熱性病之脈象為數、洪、大、弦、滑、硬；寒性病之脈象為沉、遲、弱、細、浮、虛。各種病癥均各有其表現的脈象。脈診還應與望診相結合，以測病人之生死，當病人出現下述情況者可能死亡：心脈摸不到，舌中間發黑者；肺脈摸不到，鼻翼下陷者；肝脈摸不到，下唇外翻者；腎脈摸不到，耳向后聽不見聲音者。藏醫關于臟腑的脈象與五官（舌、眼、鼻、耳、唇）的變化相聯系的觀點，彩圖中對此描繪得很生動，其本質乃是中醫臟腑學說中的心開竅于舌，肺開竅于鼻，肝開竅于目，腎開竅于耳，脾其榮在唇。藏醫脈診中還有生命脈診法，其切脈部位亦在前臂尺測與中醫切診的寸、關、尺相應的部位。
       藏醫診病，除了望診、觸診、脈診三種方法外，還有藥物試驗診斷法。總之，根據望、觸、問三診斷得到的印象，加以分析的歸納，從發病原因判斷疾病的性質，從癥狀到體征判斷方法基本相似。因而也確知藏醫在某些方面受中醫理論的巨大影響。