約自公元十五世紀開始在西藏的醫學史上形成了北方派和南方派如同日月的兩大學派。 這兩大學派都堅持《四部醫典》的總綱和理論，利用各自的智慧，予以校訂，進行廣泛的闡釋。同時結合自己的具體特點，對獨特的經驗不斷進行總結和整理。這些對西藏醫學的理論和實踐各方面都有所補充，極大地豐富了藏醫藥學。
       北方派以講，辯，著的方式結合西藏北方的地理、氣候、生活方式等實際特征，對獨具特點的醫治方法進行經驗總結，著述醫書疏解，創制新藥方，甚至辨別藥物等，發揚了北方學派的特點。南方學派以藥物味道、工用、藥效本質、釋名及其作用等方面制定論述，進行講解，介紹藥物等，以講、辯、著的形式、發揚了南方派的特點。
       公元1509年出生于前代蘇喀（南方派）家族的蘇喀·洛追杰波，幼時聽受祖先醫療傳承，拜措麥堪欽的弟子朗普卻吉等為師。另外，還拜薩迦門沖（薩迦藥城）地方的昌迪·協俄等北方學派的同門師，聽授所有醫療秘方后，著述了《藥物味道、功用、藥效表》，以北方學派《四部醫典》組成的題解等許多大小論著。晚年，他來到娘麥（日喀則一個地名）尋找，終于在此地找到新云丹貢布的《四部醫典》手抄本。后由人主旺杰扎巴創造條件，經過四年時間，憑著智慧新編醫學根本續論述《祖先口述》兩種和醫學后續脈尿《祖先口述》共三種巨著。后來抵達西藏山南地區扎唐時，由于雅加巴作施主，他對《四部醫典》原本進行校勘訂正，刻制了醫學史上第一次現在稱這為《扎唐四部醫典》的著名版本。這對西藏廣大地區講授《四部醫典》起了巨大的推動作用，留下了無法估量的豐功偉績。
 
       塔木醫學博士洛桑曲扎（公元1638年生），五世達賴給予他無比的關懷，迪司桑杰嘉繁榮昌盛也稱贊他如同“藥王”并給予高度的評價，授他為五世達賴的幫醫。在五世達賴喇嘛和迪司桑杰措執政時期，曾倡導開展藏醫藥學的繼承、發掘和整理工作。為了《扎唐四部醫典》的校勘工作順利進行，以塔木醫學博士為主，召集各派名醫，對先后刻印的版本，又進行細心地分析和校訂，對詞義等各方面做了從未有過的整理，重新進行刻版，使該書有廣泛的傳播。由此不久，在后藏（今指青海、四川、甘肅境內的藏族居住地區）塔爾寺和康區德格印經院等，陸續以拉薩的四部醫典為準，再次進行了刻印。還集體校注《四部醫內》，將原書中晦澀難懂的林文和古藏文盡量改寫成通俗文字，并撰寫了一千二百多頁的注釋，定名為，《四部醫典藍琉璃》。同時為了更好地解釋這部醫書的內容，使得賢愚人等都能順利理解，迪司桑杰嘉措還召集哈藏最著名的書畫家，整理、繪制了彩色《四部醫典系列掛圖》七十九幅。其中，不僅描述了《四部醫典》的內容尸體解剖，穴位，藥物和器械等，而且以講述藏醫理論為主的內容亦描繪在彩色掛圖里。公元1696年在拉薩藥王山創建了醫學僧院，定名為藥王山醫學利眾院，并安排塔木·洛桑曲扎醫學博士和高僧洛桑阿旺兩位主管任教，第司桑杰嘉措也親身傳授醫學理論。